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GWAS研究揭示玉米直鏈淀粉含量的遺傳結構


      來自上海交通大學的研究人員發表了題為“The Genetic Architecture of Amylose Biosynthesis in Maize Kernel”的論文,通過全基因組關聯分析系統研究了玉米籽粒中表型直鏈淀粉的含量與單核苷酸多態性的基因型的連鎖研究,篩選出了與直鏈淀粉合成相關的關聯SNPs以及有潛力的候選基因,為遺傳調控研究玉米淀粉含量和品質改良提供了重要線索。


      這一研究成果公布在Plant Biotechnology Journal雜志上,這項研究由由上海交通大學王文琴與中國科學院上海植物生理生態研究所巫永睿研究組以及沈陽農業大學黃瑞東研究組合作完成,文章的通訊作者為上海交通大學王文琴教授,第一作者為李長生。


      淀粉是玉米籽粒中含量最豐富的碳水化合物,主要包含了25%直鏈和75%左右的支鏈淀粉。跟總淀粉含量不同的是,直鏈和支鏈淀粉的各自所占的百分含量決定了食品原料和工業應用中不同的加工性能。越來越多的研究興趣轉移到遺傳控制單個直鏈或支鏈淀粉含量上,而它們生物合成的酶反應機器仍不完全清楚。 


      在這篇文章中,研究人員利用了464株玉米籽粒中表型直鏈淀粉的含量,以及對應的9,007,194SNPs的基因型,進行連鎖不平衡的全基因組關聯分析,篩選出了與直鏈淀粉合成相關的27個SNPs以及有潛力的39個候選基因,這些結果初步闡明了直鏈淀粉合成的調控網絡,對后續研究和改良玉米籽粒具有重要指導意義。 


 (本文轉載生物通)


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